Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a1P02463 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a1P02463 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms