Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01853 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01853 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01853 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01853 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01853 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01853 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01853 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01853 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01853 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01853 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01853 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01853 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01853 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01853 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01853 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01853 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01853 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01853 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01853 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01853 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01853 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01853 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01853 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01853 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01853 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01853 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01853 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01853 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01853 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms