Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01794 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01794 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01794 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01794 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01794 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01794 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01794 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01794 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01794 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01794 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01794 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01794 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01794 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01794 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01794 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01794 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01794 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01794 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01794 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01794 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01794 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01794 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01794 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01794 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01794 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01794 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01794 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01794 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01794 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01794 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01794 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01794 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01794 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01794 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01794 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01794 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01794 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01794 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01794 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01794 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01794 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01794 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01794 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01794 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01794 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01794 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01794 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01794 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01794 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01794 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01794 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01794 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms