Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01791 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01791 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01791 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01791 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01791 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01791 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01791 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01791 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01791 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01791 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01791 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01791 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01791 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01791 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01791 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01791 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01791 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01791 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01791 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01791 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01791 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01791 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01791 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01791 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01791 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms