Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01757 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01757 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01757 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01757 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01757 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01757 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01757 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01757 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01757 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01757 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01757 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01757 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01757 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01757 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01757 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01757 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01757 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01757 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01757 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01757 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01757 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01757 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01757 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01757 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01757 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01757 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01757 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01757 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01757 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01757 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01757 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01757 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01757 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01757 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01757 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01757 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01757 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01757 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01757 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01757 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01757 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01757 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01757 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01757 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01757 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms