Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01748 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01748 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01748 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01748 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01748 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01748 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01748 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01748 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01748 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01748 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01748 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01748 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01748 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01748 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01748 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01748 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01748 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01748 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01748 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01748 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01748 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01748 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01748 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01748 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01748 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01748 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01748 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01748 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01748 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01748 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01748 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01748 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01748 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01748 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01748 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01748 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01748 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01748 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01748 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01748 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01748 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01748 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01748 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01748 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms