Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pde4aO89084 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde4aO89084 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde4aO89084 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde4aO89084 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms