Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdc6O89033 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc6O89033 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc6O89033 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc6O89033 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms