Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp23O88676 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp23O88676 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms