Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pak1O88643 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pak1O88643 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pak1O88643 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pak1O88643 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pak1O88643 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pak1O88643 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pak1O88643 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pak1O88643 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms