Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema3fO88632 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema3fO88632 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms