Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme6O88425 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme6O88425 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme6O88425 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme6O88425 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme6O88425 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme6O88425 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme6O88425 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms