Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly86O88188 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly86O88188 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms