Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hcn4O70507 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hcn4O70507 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms