Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx12O70493 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx12O70493 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx12O70493 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx12O70493 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx12O70493 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx12O70493 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx12O70493 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx12O70493 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx12O70493 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snx12O70493 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx12O70493 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx12O70493 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx12O70493 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms