Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sigmar1O55242 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sigmar1O55242 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sigmar1O55242 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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