Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HcrtO55241 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HcrtO55241 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HcrtO55241 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HcrtO55241 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HcrtO55241 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HcrtO55241 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HcrtO55241 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HcrtO55241 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HcrtO55241 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HcrtO55241 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HcrtO55241 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HcrtO55241 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HcrtO55241 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HcrtO55241 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HcrtO55241 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HcrtO55241 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HcrtO55241 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HcrtO55241 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HcrtO55241 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HcrtO55241 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HcrtO55241 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HcrtO55241 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HcrtO55241 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HcrtO55241 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
HcrtO55241 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HcrtO55241 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HcrtO55241 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HcrtO55241 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HcrtO55241 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HcrtO55241 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HcrtO55241 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HcrtO55241 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HcrtO55241 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HcrtO55241 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HcrtO55241 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HcrtO55241 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HcrtO55241 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HcrtO55241 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HcrtO55241 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
HcrtO55241 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HcrtO55241 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HcrtO55241 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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