Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap1O55125 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms