Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp10O55123 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp10O55123 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp10O55123 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms