Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syngr1O55100 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngr1O55100 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms