Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SlkO54988 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SlkO54988 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SlkO54988 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms