Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarce1O54941 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarce1O54941 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms