Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limk2O54785 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Limk2O54785 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Limk2O54785 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limk2O54785 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limk2O54785 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limk2O54785 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Limk2O54785 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms