Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk2O35491 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk2O35491 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clk2O35491 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk2O35491 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk2O35491 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clk2O35491 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clk2O35491 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clk2O35491 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clk2O35491 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk2O35491 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk2O35491 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms