Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc27a2O35488 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc27a2O35488 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a2O35488 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms