Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppef2O35385 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppef2O35385 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms