Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx3O35160 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms