Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scarb2O35114 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Scarb2O35114 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Scarb2O35114 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Scarb2O35114 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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