Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sypl1O09117 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sypl1O09117 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sypl1O09117 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sypl1O09117 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sypl1O09117 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sypl1O09117 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sypl1O09117 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sypl1O09117 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sypl1O09117 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sypl1O09117 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sypl1O09117 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sypl1O09117 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sypl1O09117 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sypl1O09117 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms