Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra2O08842 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra2O08842 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra2O08842 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra2O08842 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra2O08842 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra2O08842 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra2O08842 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra2O08842 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gfra2O08842 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfra2O08842 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfra2O08842 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms