Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfil3O08750 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nfil3O08750 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nfil3O08750 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms