Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MttpO08601 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MttpO08601 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MttpO08601 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MttpO08601 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MttpO08601 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MttpO08601 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MttpO08601 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MttpO08601 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MttpO08601 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MttpO08601 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MttpO08601 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MttpO08601 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MttpO08601 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MttpO08601 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MttpO08601 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MttpO08601 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MttpO08601 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MttpO08601 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MttpO08601 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MttpO08601 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MttpO08601 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MttpO08601 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MttpO08601 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MttpO08601 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MttpO08601 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MttpO08601 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MttpO08601 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MttpO08601 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MttpO08601 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MttpO08601 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MttpO08601 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MttpO08601 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MttpO08601 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MttpO08601 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MttpO08601 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MttpO08601 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MttpO08601 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MttpO08601 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MttpO08601 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MttpO08601 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MttpO08601 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MttpO08601 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MttpO08601 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MttpO08601 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MttpO08601 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MttpO08601 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MttpO08601 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MttpO08601 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MttpO08601 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MttpO08601 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MttpO08601 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MttpO08601 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MttpO08601 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MttpO08601 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MttpO08601 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MttpO08601 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MttpO08601 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MttpO08601 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MttpO08601 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MttpO08601 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MttpO08601 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MttpO08601 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MttpO08601 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MttpO08601 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MttpO08601 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MttpO08601 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MttpO08601 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MttpO08601 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MttpO08601 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MttpO08601 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MttpO08601 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MttpO08601 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MttpO08601 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MttpO08601 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MttpO08601 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MttpO08601 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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