Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efna5O08543 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna5O08543 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna5O08543 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efna5O08543 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efna5O08543 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Efna5O08543 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Efna5O08543 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efna5O08543 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms