Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d1O08532 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d1O08532 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms