Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn2O08529 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn2O08529 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn2O08529 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Capn2O08529 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn2O08529 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn2O08529 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn2O08529 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn2O08529 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn2O08529 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn2O08529 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms