Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl4M0QW46 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms