Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20878L7N244 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20878L7N244 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20878L7N244 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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