Protein–RNA interactions for Protein: L7N1X0

Gm28044, Predicted gene, 28044, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28044L7N1X0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28044L7N1X0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms