Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9602J3QPD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9602J3QPD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9602J3QPD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms