Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sclt1G5E861 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sclt1G5E861 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms