Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Pcf11G3X9Z4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Pcf11G3X9Z4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pcf11G3X9Z4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms