Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim55G3X8Y1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim55G3X8Y1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim55G3X8Y1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms