Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ScaperF8VQ70 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ScaperF8VQ70 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms