Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r76F8VQ63 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r76F8VQ63 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r76F8VQ63 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms