Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M1F7CXU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M1F7CXU4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M1F7CXU4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms