Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5218F6YH22 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5218F6YH22 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms