Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21970F6XX07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21970F6XX07 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21970F6XX07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms