Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prl3d2F6R3P9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prl3d2F6R3P9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Prl3d2F6R3P9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prl3d2F6R3P9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prl3d2F6R3P9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms