Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms