Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
R3hdm1E9Q9Q2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 472.7 ms